清朝这边刚有动静，日本那边早已按捺不住了。日本内阁召开紧急会议，决定以保护日本公使馆的名义，也跟着出兵。首相伊藤博文、外相陆奥宗光策划成立战时大本营，派出七八千人奔赴朝鲜。日本组织的兵力大大超过了清兵。大有同清朝决一死战的阵势。在外交上，日本政府变脸极快，不承认朝鲜是清朝的藩邦。有了这个前提，你出兵，我也出兵。李鸿章就担心日本这一手，急忙照会日本政府，希望他们派兵别太多，中、日两国军队尽量避免接触，以防发生误会。日本根本不理这一套，当即回绝了李鸿章，同时照会清朝总理衙门，把没理当有理说，日本派兵依据了这个条约那个条约的，出不出兵，出兵多少跟你们清政府无关。中了人家的圈套，说什么都晚了。
两国军队浩浩荡荡地开进了朝鲜，情况却发生意想不到的转机，既不像清朝所担忧的那样，更不像日本所期盼的那样。日本驻朝公使大鸟圭介率领的日军兴冲冲地赶到汉城，发现朝鲜的动乱已经平息。不知怎么搞的，朝鲜当局“招抚”了东学党人，双方达成《全州和约》的休战协议，起义军退出曾一度占据的全州，汉城一派和平景象。中国军队驻扎牙山，纹丝未动。想趁火打劫的大鸟圭介措手不及，请示日本政府咋办。日本政府命令他赖在朝鲜别动窝。中、日两国开始打起外交口水战。